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个人认为B市应该开展初步的流行病学调查（主要为病人基本情况，症状体征，发病及治疗情况及一般的流行病学情况等），并将调查结果提供给A市，A市开展补充调查（主要完善现场调查），同时开展鼠密度调查，带毒率调查等等，其实工作的主要目的是为了控制疾病，不是为了流行病学调查。
基于现在的真实情况，建议A市自己开展流行病学调查，因为想从B市拿到调查表难度还是有的！